據各種報道，人們懷疑臭蟲可傳播的疾病達40多種，這些病原體包括病毒、立克次體、螺旋體、細菌、原蟲和蠕蟲，并且還懷疑臭蟲叮咬會導致維生素和鐵質缺乏、過敏和致癌。

在自然界曾在臭蟲體內分離到的可致病的病原體有：可致流行性斑疹傷寒的普氏立克次體，可致Q熱的伯氏立克次體，可致布魯菌病的地中海布魯桿菌，可致南美錐蟲病的克氏錐蟲以及斑氏絲蟲和馬來絲蟲。我國在南京市和四川普格縣的居民床上捕獲的臭蟲體內檢出乙肝表面抗原。在實驗室曾觀察到溫帶臭蟲感染鼠疫桿菌可在其腸內存活10～83d,回歸熱螺旋體存活1～200d,感染溶血性鏈球菌14～15d后可傳染給小白鼠、豚鼠和家兔。土拉倫斯菌被臭蟲吸入后15h能再傳給健康動物，并能在蟲體內保存毒力達250d。臭蟲叮咬麻風結節附近的皮膚后，抗酸性分支桿菌可在臭蟲消化道內存活16d。利什曼原蟲在臭蟲腸道內可存活35d,普氏立克次體可存活30d，天花病毒能在臭蟲體內繁殖并傳染給家兔。

臭蟲對人類最普遍最明顯的危害是吸血騷擾。多數人被臭蟲叮咬后瘙癢難忍，有的還發生蕁麻疹，紅腫數日不退。另外，印度還有報道臭蟲的嚴重侵害會引起缺鐵性貧血。除此之外還有報道認為臭蟲的糞便可能引起哮喘。我國經調查，室內家具染蟲程度均以床鋪為最嚴重。值得注意的是，由于我國人民生活水平提高、住房條件改善，以及對臭蟲有物資的藥物的應用，在我國臭蟲的危害一度已被控制在極低水平，但是近年來又有復燃的趨勢。